En Sesión de Pleno de la LXI Legislatura del Estado de Querétaro, fue aprobada la conformación de las 25 Comisiones Ordinarias.

 Para las designaciones se presentaron dos propuestas, quedando la del diputado Guillermo Vega (PAN) y quedaron de la siguiente manera:

Morena encabeza  la Comisión de Acceso a la Información y Rendición de Cuentas, presidida por María Blanca Flor Benítez; la de Atención de las Migraciones, con Arturo Maximiliano García; Asuntos Indígenas, a cargo de Eugenia Margarito Vázquez; Ciencia, Tecnología e Innovación, liderada por Andrea Tovar Saavedra; Gobernación, Administración Pública y Asuntos Electorales, en manos de Sinhue Piedra Gil; Igualdad de Género y Derechos Humanos, presidida por Rosalba Vázquez Munguía; Juventud y Deportes, a cargo de Édgar Inzunza Ballesteros; Puntos Constitucionales, liderada por Homero Barrera McDonald; y Seguimiento de la Agenda 2030, encabezada por Eric Silva Hernández.

El Partido del Trabajo (PT), con Claudia Díaz Gayou a cargo de la Comisión de Desarrollo Económico Sustentable, Emprendimiento y Comercio, mientras que Movimiento Ciudadano, liderará la Comisión de Seguridad Pública y Protección Civil, presidida por Teresita Calzada Rovirosa. Por último, dos comisiones estarán a cargo de diputados independientes: Ulises Gómez de la Rosa en Asuntos Municipales y Enrique Correa Sada en Movilidad Sustentable y Tránsito. 

El PAN estará al frente de la Comisión de Administración y Procuración de Justicia, presidida por Guillermo Vega Guerrero, así como la de Desarrollo Urbano, Obras Públicas y Comunicaciones, a cargo de Luis Antonio Zapata Guerrero. También tiene la Comisión de Familia y Derechos de las Niñas, Niños y Adolescentes, liderada por Leonor Mejía Barraza; la Comisión de Participación Ciudadana, a cargo de Mauricio Cárdenas; la Comisión de Planeación y Presupuesto, bajo Luis Gerardo Ángeles Herrera; la Comisión de Salud, presidida por Verónica Galicia, y la Comisión Instructora, en manos de Juliana Rosario Hernández.

Mientras que el Partido Verde presidirá dos comisiones: Desarrollo Social, Grupos Vulnerables y Vivienda, bajo María Georgina Guzmán Álvarez, y Medio Ambiente y Cambio Climático, a cargo de Patricia Flores Suárez. El Partido Revolucionario Institucional (PRI) estará al frente de la Comisión de Educación y Cultura, con Paul Ospital Carrera, y de la Comisión de Turismo, presidida por Adriana Elisa Meza.